牙周病若想成功治療，不光只要靠醫師，更也要靠患者的配合，照顧口腔衛生必須持之以恒，才能維持良好的效果，牙周病的治療方式是以控制牙周病，即恢複健康與功能，並無法完全恢複，只能穩住現有的病別讓病情惡化。 第一階段: 基礎治療階段 基礎治療階段，選用牙周病常規的治療方法，清除或控制臨床炎症和咬致病因素，包括口腔清潔，齦上潔治，齦下刮治以清除菌斑，牙石，選用抗菌藥控制炎症，咬頜調整等。先做完善且詳細的牙周病檢查。醫師會深入到牙齦發炎的底部，徹底清潔牙齒表面與深部的髒東西，包括牙菌斑、牙結石和已被汙染的齒質，同時並教導應該如何維護口腔衛生，讓發炎流血的牙周組織能緊貼牙根表面，恢複健康。 同時輔助治療：牙齦下沖洗、牙菌斑抑菌凝膠、牙周病指數評估、牙齒填補、不適當的根管治療重新治療、咬合調整等等。 牙周病療程可能要花二~三個月，以便觀察牙周組織經清除後牙齦改善的狀況，再評估要不要做手術的處理，大多數的牙周病患者在此階段治療已經有很大的改善。 第二階段: 牙周手術，手術修複治療 牙周病的治療，不一定需要手術，基本的治療可解決輕度到中度的牙周病，中度至重度牙周病就有需要手術，牙周病手術是小手術，不需要住院，手術後一般只會有輕微的不舒服，醫師會教導如何保護及保養術後的傷口，通常不會影響到生活作息。 第三階段: 複查複治階段，定期的口腔檢查保養 積極的治療牙周病後，每隔一段時間便要定期回診檢查和保養，才能永保牙周的健康，另一方面若有牙周病複發的情形，及早發現就可及早治療。
