民國三十八年(1949年)10月台灣正式歸還。國民黨政府接管台灣，考慮到地方自治的需要，乃將日本統治時期的五州三廳，改為八縣，並將日本統治時期的11市改為9省轄市、2縣轄市。 花蓮民宿,花蓮市合法民宿,花蓮民宿推薦,花蓮住宿,花蓮住宿推薦，http://hu-xi.tw/ 縣政府於民國三十五年(1946年)1月12日正式成立，縣政府設於花蓮市中山路。 民國三十五年(1946年)4月，花蓮區的壽鄉更名為壽豐鄉、研海鄉更名為新城鄉;鳳林區的西新社鄉更名為豐濱鄉。 民國三十五年(1946年)7月31日，撤銷花蓮區。 民國三十五年(1946年)9月16日，玉裏區的太平鄉更名為卓溪鄉。 民國三十五年(1946年)10月1日，士林鄉更名為秀林鄉。 民國三十六年(1947年)3月6日，鳳林區設立光複鄉，由鳳林鎮及瑞穗鄉各劃一部分增設。 民國三十七年(1948年)1月1日，吉野鄉更名為吉安鄉。 民國三十七年(1948年)1月15日，撤銷鳳林區。 民國三十九年(1950年)，太平鄉改稱為卓溪鄉。 民國三十九年(1950年)台灣省調整各縣市行政區域，其中花蓮縣行政區域照舊。 民國四十七年(1958年)6月1日，萬裏鄉更名為萬榮鄉。
