馬屎洲自然教育徑位於馬屎洲東南岸,這小島跟鹽田仔只不過一水之隔,由於沙粒沖積,慢慢形成沙嘴,結果變成連島沙洲,潮退時只要海水低於1.5米,便可從大埔三門仔經鹽田仔步行至馬屎洲,到達自然教育徑入口。自然教育徑全長1.5公里,島上有很多具代表性的古老沉積岩及多種有趣的地質構造 ,如斷層、褶曲、石英脈、結核、差異侵蝕、海蝕平台等,是欣賞岩石好去處。自然教育徑為天然海岸,路徑以沙石為主,遊覽時需特別留意潮汐漲退與濕滑的石面。